PROYECTO QUIMICA ORT DEL GENOMA HUMANO

Investigacion en Bioquimica Molecular y Proteómica 2008

Por cuarto año consecutivo los alumnos del ultimo año de la especialidad Quimica de la escuela ORT Argentina realizaran sus proyectos finales en distintas universidades y centros de investigacion con profesionales reconocidos. La metodologia de trabajo evita la transposicion didactica permitiendo a los estudiantes realizar su actividad final en los lugares donde se esta generando el conocimiento.
La articulacion entre nivel medio y el posgrado es auspiciada por el CONICET (Consejo Nacional De Investigacion Cientifica...).
Los proyectos de investigacion para el año en curso son:

1) Evaluacion de la expresion de la molecula de adhesion Cadherina epitelial en tejidos humanos normales y tumolares.
Investigador:Doctora monica Vazquez-Levin.
Instituto de Biologia y Medicina Molecular ( IBYME-CONICET).
Alumnos: Yael Dobzewicz y Gala Szapiro.
Link: http://www.proyecto-6q.blogspot.com/

2) Accion del Hexaclorobenceno (HCB) sobre la Uroporfirinogeno Decarboxilasa de una linea celular de Hepatocitos humanos. Mecanismo de accion.
Investigador:Doctora Maria del Carmen Rios de Molina.
Instituto: Departamento Quimica Biologica, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales.
Alumnos: Lucas Toiw y Uriel Frid.
Link: http://www.proyectofird-toiw08.blogspot.com/

3)Modelos experimentales de enfermedades metabólicas: Porfiria y Síndrome Metabólico. Proteómica y Metabolómica de estos disturbios.
Investigador: Dra. Marta Blanca Mazzetti.
Instituto: Departamento de Química Biológica, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales (UBA). Alumnos: Maria Duperron y Mauro Elencwajg.
Link: http://proyectofinal6q.blogspot.com/

4) Factores no hemodinámicos relacionados con la génesis y evolución de la proteinuria durante la enfermedad renal progresiva.
Investigador: Dra. Elsa Zotta.
Instituto: Laboratorio de Fisiopatogénia, Departamento de fisiología, Facultad de medicina, UBA. Alumnos: Barbara Helueni y Melanie Naiman.
Link: http://proyectoq08.blogspot.com/

5) Estudio de la participacion de la anandamida en la regulacion de la interaccion espermatozoide-ovioducto en un modelo bovino.
Investigador: Dra. Silvina Perez Martinez.
Instituto: Facultad de medicina - UBA
Alumnos: Judith Arenas Tenenbaum y Melina Braverman
Link: http://www.scienceproject08.blogspot.com/

6) El estudio de los mecanismos moleculares involucrados en la regulación del gen UGA4 de Saccharomyces cervisiae en respuesta a cambios en la disponibilidad de nutrientes con el fin de dilucidar las distintas cascadas de señales desencadenadas por dichos nutrientes y establecer sus interconexiones.
Investigador: Dra Susana Correa García.
Instituto: Departamento de Química Biologica, Facultad de ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires.
Alumnos: Iván Mikiej y Victoria Salama
Link: http://www.proyectoquimica22.blogspot.com/

7) Diagnóstico de la enfermedad de Von Willebrand (VWD) tipo 2N por técnicas fenotípicas y genotípicas.
Investigador: Dra. Adriana I. Woods.
Instituto: Instituto de Investigaciones Hematológicas "Mariano R. Castex" de la Academia Nacional de Medicina.
Alumnos: Abigail Skverer y Daniela Lin
Link: http://www.vwd-diagnostico.blogspot.com/

8) Estudio de la mielinogenesis en el sistema nervioso periferico en condiciones fisiologicas y patologicas. Participacion de celulas pluripotentes en el proceso de degeneracion-regeneracion nerviosa.
Investigador: Dra Patricia Setton-Avruj.
Instituto: Dpto de Quimica Biologica, Facultad de Farmacia y Bioquimica (IQUIFIB-UBA-CONICET).
Alumnos: Averbuj Daniel y Eitan Rozenszajn.
Link: http://www.proyectoaverbuj-rozenszajn.blogspot.com/

9) Diseño y desarrollo de vacunas antitumorales empleando bacterias y celulas tumorales modificadas con genes inmunomodiladores. Estudio de los mecanismos inmunes inducidos.
Investigador: Claudia I. Waldner y Claudia Mongini.
Instituto: Laboratorio de inmunologia celular y molecular. Centro de Estudios Farmacologicos y Botanicos (CEFYBO. CONICET-UBA)
Alumnos: Amalia Surijon y Maria Belen Tolava Rivero
Link: http://www.amibeluproyecto.blogspot.com/

10) Marcadores Geneticos Asociados al Cáncer
Investigador: Dr.Javier Hernán Cotignola
Instituto: Laboratorio de Cáncer y Apoptosis del Departamento de Quimica Biologica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales de la Universidad de Buenos Aires.
Alumnos: Ayelén Marano y Solange Perchik
Link: http://marcadoresgeneticos.blogspot.com/

11) Expresion del canal de la conductancia transmembranal de la Fibrosis Quistica (CFTR) en placentas Preeclampticas: posible rol en la regulacion de la actividad de la Acuoporina-9 (AQP9).
Investigador: Dr Alicia E Damiano
Instituto: Catedra de Biologia Celular, Departamento de Ciencias Biologicas, Facultad de Farmacia y Bioquimica (UBA)
Alumnos: Gabriel Colodenco y Martín Sapir.
Link: http://proyectofinalcs.blogspot.com/

12) Proteómica de factores secretados por células de cáncer de mama y mama normal con capacidad inhibitoria de la producción lipídica.
Investigador: Dra.Guerra de Grignoli Liliana Noemi
Instituto: Departamento de Ciencias biologicas. Facultad de ciencias exactas y naturales,UBA-CONICET.
Alumnos: Fabiana Durante y Tamara Broitman.
Link: http://tyf-proyecto08.blogspot.com/

13) Neovascularizaciòn en un modelo murino de inflamaciòn aguda inducida por LPS.
Investigador:Eulalia de la Torre.
Instituto: Facultad de Medicina - Uba - Laboratorio de Inmunofarmacologia
Alumnos: Federico Mauas Walach, Pablo Kuleff.
Link: http://www.finalproyectort.blogspot.com/

14) Interacción de sumo-1 y mage-a2 en la regulacion del oncosupresor p53
Investigador: Martín Monte
Instituto: Facultad de Ciencias Exactas y Naturales (UBA)
Alumnos: Leonel Stermann y Yair Litman
Blog: http://proyectosumo.blogspot.com/

15) Estudio de la Growth Associated Protein (GAP-43), su interacción con la Ubicutina y su participación en el control del ciclo celular en células NIH3T3 transfectadas en forma estable y transiente. Efecto de la Apo-transferrina en la remielización: participación de la vía Notch en la diferenciación oligodendrioglial.
Investigador: Doctora Ana M. Adamo.
Instituto: Departamento de Química Biológica Patológica, Facultad de Farmacia y Bioquímica de la UBA. CONICET.
Alumnos: Rodrigo C. Pampin y Robby Mattes
Link: http://www.gap-43.blogspot.com/

24 de junio de 2008

Semana IV - 05/06/08

En esta semana procedimos a trabajar con la Dra. Angela Juarez. En la misma tuvimos que obtener homogenatos de Chlorella kesseleri y Scenedesmus vacuolatus.
Para poder obtener el mismo se necesitaron:
I) Cultivo de Chlorella kesseleri y Scenedesmus vacuolatus
II) Buffer Fosfato de Potasio 0.134 M de pH 6.5
III) Buffer Fosfato de Potasio 0.134 M de pH 6.5 con Benzamidina 0.2 mM y PMSF (fluoruro de fenilmetil sulfino) 0.5 mM. Estos dos son inhibidores de proteasas.

Antes de comenzar con el procedimiento se deben hacer las siguientes preparaciones de soluciones:

* Buffer Fosfato de Potasio:
Solución stock 1 (bajo pH): PO4H2K 0.1 M (18.23 gr PO4H2K anhidro en 1000 ml de agua destilada)
Solución stock 2 (alto pH): PO4HK2 0.134 M (23.34 gr PO4HK2 anhidro en 1000 ml de agua destilada)
Preparar el Buffer 0.134 M pH 6.5 mezclando 2.5 volúmenes de Sol. 1 con 1 volumen de Sol. 2, agregándola de a poco y verificando el pH en el pHmetro, porque no es la proporción exacta.

* Buffer con inhibidores:
Prepara stock PMSF 0.2 M en etanol y stock benzamidina/ 1 buffer (preparar únicamente la cantidad de buffer con inhibidores necesaria, porque son caros y el buffer final no puede almacenarse)


Luego de haber preparado las correspondientes soluciones, se procedió a la obtención de los homogenatos de Chlorella kessleri y Scenedesmus vacuolatus:

* Cosechar las células por centrifugación (15 min. a 7000 rpm, centrifuga refrigerada)




* Descartar el sobrenadante (medio de cultivo) implementando el uso de la pipeta pasteur



* Lavar las células con 10 ml de buffer Fosfato de Potasio 0.134 M pH 6.5 conteniendo inhibidores de proteasas * Centrifugar 15 min a 7000 rpm (misma centrifuga)


* Descartar el sobrenadante (pipeta pasteur) y recoger las células resuspendiéndolas en el menor volumen posible de buffer con inhibidores ( debe quedar espeso) en un tubo apropiado para sonicar ( eppendorf o tubos centrifuga sorvall)






* Sonicar en sonicador de tip (a la maxima potencia que permita el aparato y el tip) 7 veces por 15 segundos cada vez (con el tip en un vaso de precipitados lleno de hielo y dejando enfriar entre los pulsos). Cabe destacar que el volumen a sonicar no debe sobrepasar la mitad del tubo utilizado, sino este podria romperse ya que el sonicador provoca energia intensa liberada en forma calorica.





Debido a la falta de tiempo, no pudimos seguir. Pero la tecnica termina de la siguiente manera:

* Centrifugar 25 min. a 11500 rpm
* El pellet obtenido corresponde a los núcleos, mitocondrias, cloroplastos y derbis celulares.
* El sobrenadante corresponde a la fracción soluble citosólica y que llamamos sobrenadante de homogenato o extracto algal citosólico (puede almacenarse a -20ºC por unos 15 días para determinar finalmente la actividad UroD)


Lucas Toiw
Uriel Frid

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