PROYECTO QUIMICA ORT DEL GENOMA HUMANO

Investigacion en Bioquimica Molecular y Proteómica 2008

Por cuarto año consecutivo los alumnos del ultimo año de la especialidad Quimica de la escuela ORT Argentina realizaran sus proyectos finales en distintas universidades y centros de investigacion con profesionales reconocidos. La metodologia de trabajo evita la transposicion didactica permitiendo a los estudiantes realizar su actividad final en los lugares donde se esta generando el conocimiento.
La articulacion entre nivel medio y el posgrado es auspiciada por el CONICET (Consejo Nacional De Investigacion Cientifica...).
Los proyectos de investigacion para el año en curso son:

1) Evaluacion de la expresion de la molecula de adhesion Cadherina epitelial en tejidos humanos normales y tumolares.
Investigador:Doctora monica Vazquez-Levin.
Instituto de Biologia y Medicina Molecular ( IBYME-CONICET).
Alumnos: Yael Dobzewicz y Gala Szapiro.
Link: http://www.proyecto-6q.blogspot.com/

2) Accion del Hexaclorobenceno (HCB) sobre la Uroporfirinogeno Decarboxilasa de una linea celular de Hepatocitos humanos. Mecanismo de accion.
Investigador:Doctora Maria del Carmen Rios de Molina.
Instituto: Departamento Quimica Biologica, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales.
Alumnos: Lucas Toiw y Uriel Frid.
Link: http://www.proyectofird-toiw08.blogspot.com/

3)Modelos experimentales de enfermedades metabólicas: Porfiria y Síndrome Metabólico. Proteómica y Metabolómica de estos disturbios.
Investigador: Dra. Marta Blanca Mazzetti.
Instituto: Departamento de Química Biológica, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales (UBA). Alumnos: Maria Duperron y Mauro Elencwajg.
Link: http://proyectofinal6q.blogspot.com/

4) Factores no hemodinámicos relacionados con la génesis y evolución de la proteinuria durante la enfermedad renal progresiva.
Investigador: Dra. Elsa Zotta.
Instituto: Laboratorio de Fisiopatogénia, Departamento de fisiología, Facultad de medicina, UBA. Alumnos: Barbara Helueni y Melanie Naiman.
Link: http://proyectoq08.blogspot.com/

5) Estudio de la participacion de la anandamida en la regulacion de la interaccion espermatozoide-ovioducto en un modelo bovino.
Investigador: Dra. Silvina Perez Martinez.
Instituto: Facultad de medicina - UBA
Alumnos: Judith Arenas Tenenbaum y Melina Braverman
Link: http://www.scienceproject08.blogspot.com/

6) El estudio de los mecanismos moleculares involucrados en la regulación del gen UGA4 de Saccharomyces cervisiae en respuesta a cambios en la disponibilidad de nutrientes con el fin de dilucidar las distintas cascadas de señales desencadenadas por dichos nutrientes y establecer sus interconexiones.
Investigador: Dra Susana Correa García.
Instituto: Departamento de Química Biologica, Facultad de ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires.
Alumnos: Iván Mikiej y Victoria Salama
Link: http://www.proyectoquimica22.blogspot.com/

7) Diagnóstico de la enfermedad de Von Willebrand (VWD) tipo 2N por técnicas fenotípicas y genotípicas.
Investigador: Dra. Adriana I. Woods.
Instituto: Instituto de Investigaciones Hematológicas "Mariano R. Castex" de la Academia Nacional de Medicina.
Alumnos: Abigail Skverer y Daniela Lin
Link: http://www.vwd-diagnostico.blogspot.com/

8) Estudio de la mielinogenesis en el sistema nervioso periferico en condiciones fisiologicas y patologicas. Participacion de celulas pluripotentes en el proceso de degeneracion-regeneracion nerviosa.
Investigador: Dra Patricia Setton-Avruj.
Instituto: Dpto de Quimica Biologica, Facultad de Farmacia y Bioquimica (IQUIFIB-UBA-CONICET).
Alumnos: Averbuj Daniel y Eitan Rozenszajn.
Link: http://www.proyectoaverbuj-rozenszajn.blogspot.com/

9) Diseño y desarrollo de vacunas antitumorales empleando bacterias y celulas tumorales modificadas con genes inmunomodiladores. Estudio de los mecanismos inmunes inducidos.
Investigador: Claudia I. Waldner y Claudia Mongini.
Instituto: Laboratorio de inmunologia celular y molecular. Centro de Estudios Farmacologicos y Botanicos (CEFYBO. CONICET-UBA)
Alumnos: Amalia Surijon y Maria Belen Tolava Rivero
Link: http://www.amibeluproyecto.blogspot.com/

10) Marcadores Geneticos Asociados al Cáncer
Investigador: Dr.Javier Hernán Cotignola
Instituto: Laboratorio de Cáncer y Apoptosis del Departamento de Quimica Biologica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales de la Universidad de Buenos Aires.
Alumnos: Ayelén Marano y Solange Perchik
Link: http://marcadoresgeneticos.blogspot.com/

11) Expresion del canal de la conductancia transmembranal de la Fibrosis Quistica (CFTR) en placentas Preeclampticas: posible rol en la regulacion de la actividad de la Acuoporina-9 (AQP9).
Investigador: Dr Alicia E Damiano
Instituto: Catedra de Biologia Celular, Departamento de Ciencias Biologicas, Facultad de Farmacia y Bioquimica (UBA)
Alumnos: Gabriel Colodenco y Martín Sapir.
Link: http://proyectofinalcs.blogspot.com/

12) Proteómica de factores secretados por células de cáncer de mama y mama normal con capacidad inhibitoria de la producción lipídica.
Investigador: Dra.Guerra de Grignoli Liliana Noemi
Instituto: Departamento de Ciencias biologicas. Facultad de ciencias exactas y naturales,UBA-CONICET.
Alumnos: Fabiana Durante y Tamara Broitman.
Link: http://tyf-proyecto08.blogspot.com/

13) Neovascularizaciòn en un modelo murino de inflamaciòn aguda inducida por LPS.
Investigador:Eulalia de la Torre.
Instituto: Facultad de Medicina - Uba - Laboratorio de Inmunofarmacologia
Alumnos: Federico Mauas Walach, Pablo Kuleff.
Link: http://www.finalproyectort.blogspot.com/

14) Interacción de sumo-1 y mage-a2 en la regulacion del oncosupresor p53
Investigador: Martín Monte
Instituto: Facultad de Ciencias Exactas y Naturales (UBA)
Alumnos: Leonel Stermann y Yair Litman
Blog: http://proyectosumo.blogspot.com/

15) Estudio de la Growth Associated Protein (GAP-43), su interacción con la Ubicutina y su participación en el control del ciclo celular en células NIH3T3 transfectadas en forma estable y transiente. Efecto de la Apo-transferrina en la remielización: participación de la vía Notch en la diferenciación oligodendrioglial.
Investigador: Doctora Ana M. Adamo.
Instituto: Departamento de Química Biológica Patológica, Facultad de Farmacia y Bioquímica de la UBA. CONICET.
Alumnos: Rodrigo C. Pampin y Robby Mattes
Link: http://www.gap-43.blogspot.com/

17 de julio de 2008

Semana IX - 10/07/08

Esta semana nos dedicamos a preparar muestras nuevamente para repetir el Ensayo de Electroforesis de Células Individuales (Ensayo Cometa).
Estuvimos trabajando con Gabriela Chaufan e Isis haciendo los pasos que la vez anterior no habiamos realizado. (Ver Semana V)
Primero Fuimos al cuarto de cultivo y resuspendimos con tripsina las células tratadas con distintas concentraciones de hexaclorobenceno y las colocamos en tubos para luego preparar los portaobjetos.
Luego, partiendo de portaobjetos ya cubiertos con una capa de agarosa de bajo punto de fusión, agregamos una capa muy delgada de las células anteriormente dichas, inmersas en agarosa de alto punto de fusión.
Una vez puesta la capa, es necesario dejarlo en hielo para acelerar la solidificación del agar.
Con el medio ya sólido, retiramos los cubreobjetos y así quedan listos los preparados.
La semana próxima repetiremos la corrida electroforética esperando nuevos resultados.

Actualizaremos nuevamente la semana que viene.

Uriel Frid
Lucas Toiw

7 de julio de 2008

Semana VIII - 03/07/08

Esta semana nos dedicamos a continuar con lo de la semana pasada, solo que esta vez con Chlorella kessleri.

Se procedió exactamente igual que la semana pasada, solo con una diferencia: cuando quisimos hacer el recuento en la cámara de Neubauer, la mezcla estaba muy concentrada (ya estaba en una dilución al 1/2) así que la volvimos a diluir al 1/2 una vez más, obteniendo así una dilución total al 1/4.




El método de recuento fue hecho con el mismo procedimiento que en el caso de Scenedesmus.


Finalmente, se pudo obtener una media de 900.5, un Desvio Starndard de 40.62723, con un n=8 y con un valor crítico de 1.895.


Luego usando la misma cuenta, sacamos el error:


SD/raíz(n)/media . VC.100


El error nos dio 3.23142%, por lo que esta más que bien.


Después de sacar el error hicimos el mismo razonamiento que la semana pasada para calcular el número de Células de Chlorella que hay en 1 ml de cultivo:


*Si en el sector que contamos hay un volumen de 0.1x10-3 ml y el promedio obtenido fue de 900.5 Células entonces en 1 ml hay 9005000 Células.


*Esas Células se encuentran en una dilución al 1/4, por lo que se debe multiplicar por cuatro la cantidad de Células. Entonces tenemos 36020000 Células/ml.


*Nosotros en realidad teníamos 0.5 ml de muestra mas 0.05 ml de Formol, osea 0.55 ml de muestra inicial, por lo que si en 1 ml de muestra hay 36020000 Células en 0.55 hay 19811000 Células.



*Entonces: si en 0.5 ml de cultivo hay 19811000 Células, en 1 ml hay 39622000 Células.



Como conclusión podemos decir que en 1 ml de cultivo de Chlorella kessleri hay 39622000 Células, es decir muchas más que las obtenidas en Scenedesmus.





Al ser Células mas chiquitas, tienen una tasa de división celular mayor, y debido a que las células de Chlorella y las de Scenedesmus estuvieron en incubación el mismo tiempo, las de Chlorella se pudieron multiplicar mas, y de ahí viene la necesidad de volver a diluir la muestra.



Hasta la semana que viene


Lucas Toiw
Uriel Frid

4 de julio de 2008

Semana VII - 27/06/08

Esta semana básicamente lo que se hizo fue un recuento de Células de Scenedesmus en cámara de Neubauer.

Se trabajo con 0.5 ml de la muestra con un agregado de 0.05 ml de Formol, lo que permitia que se conservara la misma.

Debido a que la muestra se encontraba muy concentrada, con agua destilada se procedió a una dilución al 1/2 obteniendo así un recuento mas fácil.

Luego de la dilución y con un microscopio cada uno, empezamos con el conteo.




El método de recuento de Células se basa en contar las mismas por cada cuadrante (B) en los cuadrantes grandes (A) (ver imágen). Luego se suman todas las Células por cuadrante (A). Se realizan tantos recuentos como sea necesario para lograr un error menor o igual al 10% (estimado de acuerdo con las ecuaciones que figuran más abjo) y se saca una media. Esta media nos sirve para calcular el número de células por mililitro de cultivo.







La fórmula para determinar el error consiste en lo siguiente:


(SD/raíz(n)/media . VC.100

Donde SD es el Desvio Standard, VC es el Valor de Confianza de 1.895 para un n=8 donde n es el número de recuentos.

Reemplazando los valores en los respectivos lugares se obtuvo un error del 9.12176%, por lo que se procedió correctamente.




Luego queríamos saber cuantas Células habían en la muestra inicial, por lo que razonamos lo siguiente:


*Si en el sector que contamos hay un volumen de 0.1x10-3 ml y el promedio obtenido fue de 339.625 Células entonces en 1 ml hay 3396250 Células.


*Esas Células se encuentran en una dilución al 1/2, por lo que se debe multiplicar por dos la cantidad de Células. Entonces tenemos 6792500 Células/ml.


*Nosotros en realidad teníamos 0.5 ml de muestra mas 0.05 ml de Formol, osea 0.55 ml de muestra inicial, por lo que si en 1 ml de muestra hay 6792500 Células en 0.55 hay 3735875 Células.


*Entonces: si en 0.5 ml de cultivo hay 3735875 Células, en 1 ml hay 7471750 Células.


Como conclusión podemos decir que en 1 ml de muestra de Scenedesmus hay 7471750 Células.


Debido a la falta de tiempo, la semana que viene realizaremos el recuento de Chlorella kessleri.

Hasta la semana que viene,

Lucas Toiw
Uriel Frid