PROYECTO QUIMICA ORT DEL GENOMA HUMANO

Investigacion en Bioquimica Molecular y Proteómica 2008

Por cuarto año consecutivo los alumnos del ultimo año de la especialidad Quimica de la escuela ORT Argentina realizaran sus proyectos finales en distintas universidades y centros de investigacion con profesionales reconocidos. La metodologia de trabajo evita la transposicion didactica permitiendo a los estudiantes realizar su actividad final en los lugares donde se esta generando el conocimiento.
La articulacion entre nivel medio y el posgrado es auspiciada por el CONICET (Consejo Nacional De Investigacion Cientifica...).
Los proyectos de investigacion para el año en curso son:

1) Evaluacion de la expresion de la molecula de adhesion Cadherina epitelial en tejidos humanos normales y tumolares.
Investigador:Doctora monica Vazquez-Levin.
Instituto de Biologia y Medicina Molecular ( IBYME-CONICET).
Alumnos: Yael Dobzewicz y Gala Szapiro.
Link: http://www.proyecto-6q.blogspot.com/

2) Accion del Hexaclorobenceno (HCB) sobre la Uroporfirinogeno Decarboxilasa de una linea celular de Hepatocitos humanos. Mecanismo de accion.
Investigador:Doctora Maria del Carmen Rios de Molina.
Instituto: Departamento Quimica Biologica, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales.
Alumnos: Lucas Toiw y Uriel Frid.
Link: http://www.proyectofird-toiw08.blogspot.com/

3)Modelos experimentales de enfermedades metabólicas: Porfiria y Síndrome Metabólico. Proteómica y Metabolómica de estos disturbios.
Investigador: Dra. Marta Blanca Mazzetti.
Instituto: Departamento de Química Biológica, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales (UBA). Alumnos: Maria Duperron y Mauro Elencwajg.
Link: http://proyectofinal6q.blogspot.com/

4) Factores no hemodinámicos relacionados con la génesis y evolución de la proteinuria durante la enfermedad renal progresiva.
Investigador: Dra. Elsa Zotta.
Instituto: Laboratorio de Fisiopatogénia, Departamento de fisiología, Facultad de medicina, UBA. Alumnos: Barbara Helueni y Melanie Naiman.
Link: http://proyectoq08.blogspot.com/

5) Estudio de la participacion de la anandamida en la regulacion de la interaccion espermatozoide-ovioducto en un modelo bovino.
Investigador: Dra. Silvina Perez Martinez.
Instituto: Facultad de medicina - UBA
Alumnos: Judith Arenas Tenenbaum y Melina Braverman
Link: http://www.scienceproject08.blogspot.com/

6) El estudio de los mecanismos moleculares involucrados en la regulación del gen UGA4 de Saccharomyces cervisiae en respuesta a cambios en la disponibilidad de nutrientes con el fin de dilucidar las distintas cascadas de señales desencadenadas por dichos nutrientes y establecer sus interconexiones.
Investigador: Dra Susana Correa García.
Instituto: Departamento de Química Biologica, Facultad de ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires.
Alumnos: Iván Mikiej y Victoria Salama
Link: http://www.proyectoquimica22.blogspot.com/

7) Diagnóstico de la enfermedad de Von Willebrand (VWD) tipo 2N por técnicas fenotípicas y genotípicas.
Investigador: Dra. Adriana I. Woods.
Instituto: Instituto de Investigaciones Hematológicas "Mariano R. Castex" de la Academia Nacional de Medicina.
Alumnos: Abigail Skverer y Daniela Lin
Link: http://www.vwd-diagnostico.blogspot.com/

8) Estudio de la mielinogenesis en el sistema nervioso periferico en condiciones fisiologicas y patologicas. Participacion de celulas pluripotentes en el proceso de degeneracion-regeneracion nerviosa.
Investigador: Dra Patricia Setton-Avruj.
Instituto: Dpto de Quimica Biologica, Facultad de Farmacia y Bioquimica (IQUIFIB-UBA-CONICET).
Alumnos: Averbuj Daniel y Eitan Rozenszajn.
Link: http://www.proyectoaverbuj-rozenszajn.blogspot.com/

9) Diseño y desarrollo de vacunas antitumorales empleando bacterias y celulas tumorales modificadas con genes inmunomodiladores. Estudio de los mecanismos inmunes inducidos.
Investigador: Claudia I. Waldner y Claudia Mongini.
Instituto: Laboratorio de inmunologia celular y molecular. Centro de Estudios Farmacologicos y Botanicos (CEFYBO. CONICET-UBA)
Alumnos: Amalia Surijon y Maria Belen Tolava Rivero
Link: http://www.amibeluproyecto.blogspot.com/

10) Marcadores Geneticos Asociados al Cáncer
Investigador: Dr.Javier Hernán Cotignola
Instituto: Laboratorio de Cáncer y Apoptosis del Departamento de Quimica Biologica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales de la Universidad de Buenos Aires.
Alumnos: Ayelén Marano y Solange Perchik
Link: http://marcadoresgeneticos.blogspot.com/

11) Expresion del canal de la conductancia transmembranal de la Fibrosis Quistica (CFTR) en placentas Preeclampticas: posible rol en la regulacion de la actividad de la Acuoporina-9 (AQP9).
Investigador: Dr Alicia E Damiano
Instituto: Catedra de Biologia Celular, Departamento de Ciencias Biologicas, Facultad de Farmacia y Bioquimica (UBA)
Alumnos: Gabriel Colodenco y Martín Sapir.
Link: http://proyectofinalcs.blogspot.com/

12) Proteómica de factores secretados por células de cáncer de mama y mama normal con capacidad inhibitoria de la producción lipídica.
Investigador: Dra.Guerra de Grignoli Liliana Noemi
Instituto: Departamento de Ciencias biologicas. Facultad de ciencias exactas y naturales,UBA-CONICET.
Alumnos: Fabiana Durante y Tamara Broitman.
Link: http://tyf-proyecto08.blogspot.com/

13) Neovascularizaciòn en un modelo murino de inflamaciòn aguda inducida por LPS.
Investigador:Eulalia de la Torre.
Instituto: Facultad de Medicina - Uba - Laboratorio de Inmunofarmacologia
Alumnos: Federico Mauas Walach, Pablo Kuleff.
Link: http://www.finalproyectort.blogspot.com/

14) Interacción de sumo-1 y mage-a2 en la regulacion del oncosupresor p53
Investigador: Martín Monte
Instituto: Facultad de Ciencias Exactas y Naturales (UBA)
Alumnos: Leonel Stermann y Yair Litman
Blog: http://proyectosumo.blogspot.com/

15) Estudio de la Growth Associated Protein (GAP-43), su interacción con la Ubicutina y su participación en el control del ciclo celular en células NIH3T3 transfectadas en forma estable y transiente. Efecto de la Apo-transferrina en la remielización: participación de la vía Notch en la diferenciación oligodendrioglial.
Investigador: Doctora Ana M. Adamo.
Instituto: Departamento de Química Biológica Patológica, Facultad de Farmacia y Bioquímica de la UBA. CONICET.
Alumnos: Rodrigo C. Pampin y Robby Mattes
Link: http://www.gap-43.blogspot.com/

27 de noviembre de 2008

Semana XXII - 27/11/08

Este es el ultimo posteo de nuestro blog.

En resumen a nuestro trabajo, entrega, exibicion y por supuesto el blog,obtuvimos la calificacion de 10. Para evaluar el trabajo estuvieron presentes todos los profesores del area y los supervisores integrando asimismo el respectivo jurado.

Damos por finalizado el Proyecto Final 2008 para 6to. Quimica de la Escuela Tecnica ORT sede Almagro.

A continuacion les dejaremos nuestro trabajo.
Muhcas Gracias,
Lucas Toiw y Uriel Frid.





















19 de noviembre de 2008

Semana XXI - 06/11/08

En esta ultima semana de pasantia del año, nos dedicamos a cerrar el tema de la monografia y comenzar con el coloquio final del proyecto. Para esto, Maria Del Carmen nos estuvo mostrando calses, trabajos y otras monografia y publicaciones.

Asi finalizamos nuestra pasantia por Ciudad Universitaria para Proyecto Final 2008.

Exponeremos el proyecto el dia 19/11/08

Hasta entonces,

Lucas toiw
Uriel Frid

Semana XX - 30/10/08

Esta semana nos dedicamos a trabajar con Ángela sobre el tema de Algas para completar la introducción.

También nos dedicamos a acomadar todos los datos de la monografía.

La semana proxima (ultima Semana) vamos a volver a actualizar


Lucas Toiw
Uriel Frid

Semana XIX - 23/10/08

Esta semana nos dedicamos a discutir los resultados obtenidos con el objetivo de obtener las discuciones para el proyecto.

Agregamos a nuestro proyecto las discuciones de:

* Crecimiento de Hepatocitos humanos
* Catalasa
* SOD
* GSH
* Proteinas
* Ensayo Cometa

Volveremos a actualizar el blog la semana entrante

Lucas Toiw
Uriel Frid

Semana XVIII - 16/10/08

Esta semana para seguir completando la monografia, procedimos a reveer todos los protocolos y ensayos realizados durante todo el año con ewl objetivo de registrar las marcas de los reactivos y los modelos de los equipos utilizados.

Con todo esto empezamos a escribir la sección de Materiales y Metodos de nuestra monografia.

Hasta la semana que viene

Lucas Toiw
Uriel Frid

Semana XVII - 9/10/08

Esta semana nos dedicamos a trabajar sobre la monografia.

Analizamos resultados de:

* Determinación de Catalasa
* Ensayo Cometa
* Determincaión de GSH
* Actividad SOD

Acutualizaremos la semana que viene

Lucas Toiw
Uriel Frid

2 de octubre de 2008

Semana XVI - 02/10/08

Esta semana trabajamos con Gabriela en el armado de distintos preparados.

En esta ocación preparamos 8 tubos con lo siguiente:
Tubo 1: Control (sólo células de hepatocitos humanos)
Tubo 2: Hepatocitos humanos + HCB
Tubo 3: Hepatocitos humanos + extractos de algas
Tubo 4: Hepatocitos humanos + extractos de algas + HCB

(Realizamos duplicados de los 4 tubos)


Con esto buscamos comprobar que el HCB genera estrés oxidativo y que los extractos de algas sirven como un buen antioxidante para contrarrestar el efecto.

Para el preparado de los tubos:

Tubo 1:
Simplemente desechamos el medio y lo reemplazamos por medio nuevo.


Tubo 2:
Desechamos el medio y lo reemplazamos por otro que fue preparado de la siguiente manera:
Tomamos 5μl de una solucion de HCB/EtOH sonicada previamente en sonicador de agua y lo llevamos a 5ml con PBS. Luego tomamos 10μl de esta solución y lo llevamos a 10ml de medio.


Tubo 3:
Desechamos el medio y lo reemplazamos por otro que fue preparado de la siguiente manera:
Tomamos 8ml de medio y lo suplementamos con 400μl de extractos de Chlorella kessleri


Tubo 4:
Desechamos el medio y lo reemplazamos por otro que fue preparado de la siguiente manera:
Tomamos 8ml del medio preparado con HCB (ver Tubo 2) y lo suplementamos con 200 μl de extractos de Chlorella kessleri.


Eso fue todo por esta semana
Volveremos a actualizar dentro de dos semanas debido al feriado de Iom Kipur!
Gmar Jatimá Tová

Uriel Frid
Lucas Toiw.

25 de septiembre de 2008

Semana XV - 25/09/08

Esta semana nos dedicamos a actualizar el blog y corregir algunos errores junto con María del Carmen y Angela.




Nos vemos la semana siguiente

Uriel Frid
Lucas Toiw

Semana XIV - 18/09/08

Hola! Estamos acá actualizando nuevamente!

Esta semana trabajamos con Gabriela.
Lo que hicimos en esta ocación fue descongelar células de hepatocitos humanos.
Para esto, primero las sacamos de la cuva de nitrógeno líquido en la que se preservaban a -190ºC.



Para poder presevar las células de esta forma, se les agrega dimetilsulfóxido, un compuesto que como efecto colateral es tóxico para las células, es por eso que para descongelarlas hay que cambiar el medio.
Para esto primero se debe descongelar las células en un baño maría a 37ºC.

Luego lo centrifugamos a 130 revoluciónes durante 5 minutos para que las células se asienten abajo.

Una vez que obtenemos el precipitado, extraemos el medio que contenía dimetilsulfóxido y lo reemplazamos por uno nuevo diluyendo las células para de esa forma también diluir el tóxico que haya quedado.

Eso fue todo por esa semana
Nos vemos la semana siguiente!!

Uriel Frid
Lucas Toiw

Semana XIII - 11/09/08

Esta semana nos dedicamos a realizar la tecnica de Bradford para la determincacion de proteinas.
El metodo consiste en una determincaion espectrofotometrica de proteinas coloreadas al reaccionar con el Bradford.



Los resultados fueron los siguientes:











Luego de realizar el Bradford, calculamos los indices cometa en base a resultados obtenidos previamente por la Dra. Gabriela Chaufan (Para entender la determinación de los índices, vease semana "VI - 19/06/08").





En esta ocación los resultados fueron:




La semana que viene volveremos a actualizar el Blog!

Hasta entonces...


Uriel Frid
Lucas Toiw

18 de agosto de 2008

Introducción

Adjuntamos aquí la Introducción de nuestro Paper sobre el Proyecto.

Read this document on Scribd: introduccion del Paper de nuestro Proyecto Final


Para poder ver la introducción en grande, se debe clickear en el icono de la barra que en la siguiente imagen aparece marcado en la barra con un círculo rojo
Read this document on Scribd: Introduccion del Paper de nuestro Proyecto Final

Para poder ajustar el zoom deseado, una vez que haya ampleado el documento, se debe hacer utilizando los iconos que aparecen en la barra señalados con un circulo rojo en la siguiente imagen

También se puede acceder a la introducción a través del siguiente link:
http://www.scribd.com/doc/4852523/introduccion-del-Paper-de-nuestro-Proyecto-Final

Hasta la próxima actualización!
Uriel Frid
Lucas Toiw

Semana XII - 14/08/08

Esta semana no concurrimos a la pasantía ya que nuestros investigadores así nos pidieron que lo hagamos.

Nos vemos la semana que viene!

Uriel Frid
Lucas Toiw

17 de agosto de 2008

Semana XI - 24/07/08

Es para nosotros un gusto, estar hoy acá actualizando nuevamente nuestro blog.

Esta semana dejamos el guardapolvo en la mochila y empezamos a ver un poco, con la ayuda de la Dra. Ángela Juárez, cómo había que realizar nuestra Introducción y en qué orden debíamos explicar los distintos avances que habíamos realizado.

Hicimos un poco de memoria y recordamos todas las técnicas aplicadas, los objetivos planteados, los resultados obtenidos y los avances alcanzados y con todo esto planteamos la idea de nuestra Introducción.

Para guiarnos un poco, estuvimos viendo otras introducciones y diferentes trabajos vinculados al tema para poder así tener un poco más de idea sobre lo que estábamos haciendo.

Ahora sí, nos despedimos
Hasta dentro de 2 semanas!!
FELICES VACACIONES!!!!

Uriel Frid
Lucas Toiw

Semana X - 17/07/08

Hola! Acá estamos de nuevo actualizando el blog.
Sinceramente de esta semana sí es mucho lo que hicimos, pero sin embargo no hay mucho para contar.

¿Que es lo que hicimos?
Repetimos el ensayo cometa vara ver una vez más el daño producido por el hexaclorobenceno sobre el núcleo celular de los hepatocitos humanos.
(Para mayor información volver a la Semana V para entender en qué consiste la técnica)

¿Como fueron los resultados?
No pudimos sacar provecho de la técnica ni cuantificar los valores cometa de los núcleos ya que contábamos con pocas células (menos de 100, el cual es el mínimo indicado en el protocolo).

Por lo tanto, un poco desilusionados pero con muchas expectativas sobre las futuras repeticiones del ensayo, finalizamos nuestra jornada.

Hasta la semana siguiente!

Uriel Frid
Lucas Toiw

17 de julio de 2008

Semana IX - 10/07/08

Esta semana nos dedicamos a preparar muestras nuevamente para repetir el Ensayo de Electroforesis de Células Individuales (Ensayo Cometa).
Estuvimos trabajando con Gabriela Chaufan e Isis haciendo los pasos que la vez anterior no habiamos realizado. (Ver Semana V)
Primero Fuimos al cuarto de cultivo y resuspendimos con tripsina las células tratadas con distintas concentraciones de hexaclorobenceno y las colocamos en tubos para luego preparar los portaobjetos.
Luego, partiendo de portaobjetos ya cubiertos con una capa de agarosa de bajo punto de fusión, agregamos una capa muy delgada de las células anteriormente dichas, inmersas en agarosa de alto punto de fusión.
Una vez puesta la capa, es necesario dejarlo en hielo para acelerar la solidificación del agar.
Con el medio ya sólido, retiramos los cubreobjetos y así quedan listos los preparados.
La semana próxima repetiremos la corrida electroforética esperando nuevos resultados.

Actualizaremos nuevamente la semana que viene.

Uriel Frid
Lucas Toiw

7 de julio de 2008

Semana VIII - 03/07/08

Esta semana nos dedicamos a continuar con lo de la semana pasada, solo que esta vez con Chlorella kessleri.

Se procedió exactamente igual que la semana pasada, solo con una diferencia: cuando quisimos hacer el recuento en la cámara de Neubauer, la mezcla estaba muy concentrada (ya estaba en una dilución al 1/2) así que la volvimos a diluir al 1/2 una vez más, obteniendo así una dilución total al 1/4.




El método de recuento fue hecho con el mismo procedimiento que en el caso de Scenedesmus.


Finalmente, se pudo obtener una media de 900.5, un Desvio Starndard de 40.62723, con un n=8 y con un valor crítico de 1.895.


Luego usando la misma cuenta, sacamos el error:


SD/raíz(n)/media . VC.100


El error nos dio 3.23142%, por lo que esta más que bien.


Después de sacar el error hicimos el mismo razonamiento que la semana pasada para calcular el número de Células de Chlorella que hay en 1 ml de cultivo:


*Si en el sector que contamos hay un volumen de 0.1x10-3 ml y el promedio obtenido fue de 900.5 Células entonces en 1 ml hay 9005000 Células.


*Esas Células se encuentran en una dilución al 1/4, por lo que se debe multiplicar por cuatro la cantidad de Células. Entonces tenemos 36020000 Células/ml.


*Nosotros en realidad teníamos 0.5 ml de muestra mas 0.05 ml de Formol, osea 0.55 ml de muestra inicial, por lo que si en 1 ml de muestra hay 36020000 Células en 0.55 hay 19811000 Células.



*Entonces: si en 0.5 ml de cultivo hay 19811000 Células, en 1 ml hay 39622000 Células.



Como conclusión podemos decir que en 1 ml de cultivo de Chlorella kessleri hay 39622000 Células, es decir muchas más que las obtenidas en Scenedesmus.





Al ser Células mas chiquitas, tienen una tasa de división celular mayor, y debido a que las células de Chlorella y las de Scenedesmus estuvieron en incubación el mismo tiempo, las de Chlorella se pudieron multiplicar mas, y de ahí viene la necesidad de volver a diluir la muestra.



Hasta la semana que viene


Lucas Toiw
Uriel Frid

4 de julio de 2008

Semana VII - 27/06/08

Esta semana básicamente lo que se hizo fue un recuento de Células de Scenedesmus en cámara de Neubauer.

Se trabajo con 0.5 ml de la muestra con un agregado de 0.05 ml de Formol, lo que permitia que se conservara la misma.

Debido a que la muestra se encontraba muy concentrada, con agua destilada se procedió a una dilución al 1/2 obteniendo así un recuento mas fácil.

Luego de la dilución y con un microscopio cada uno, empezamos con el conteo.




El método de recuento de Células se basa en contar las mismas por cada cuadrante (B) en los cuadrantes grandes (A) (ver imágen). Luego se suman todas las Células por cuadrante (A). Se realizan tantos recuentos como sea necesario para lograr un error menor o igual al 10% (estimado de acuerdo con las ecuaciones que figuran más abjo) y se saca una media. Esta media nos sirve para calcular el número de células por mililitro de cultivo.







La fórmula para determinar el error consiste en lo siguiente:


(SD/raíz(n)/media . VC.100

Donde SD es el Desvio Standard, VC es el Valor de Confianza de 1.895 para un n=8 donde n es el número de recuentos.

Reemplazando los valores en los respectivos lugares se obtuvo un error del 9.12176%, por lo que se procedió correctamente.




Luego queríamos saber cuantas Células habían en la muestra inicial, por lo que razonamos lo siguiente:


*Si en el sector que contamos hay un volumen de 0.1x10-3 ml y el promedio obtenido fue de 339.625 Células entonces en 1 ml hay 3396250 Células.


*Esas Células se encuentran en una dilución al 1/2, por lo que se debe multiplicar por dos la cantidad de Células. Entonces tenemos 6792500 Células/ml.


*Nosotros en realidad teníamos 0.5 ml de muestra mas 0.05 ml de Formol, osea 0.55 ml de muestra inicial, por lo que si en 1 ml de muestra hay 6792500 Células en 0.55 hay 3735875 Células.


*Entonces: si en 0.5 ml de cultivo hay 3735875 Células, en 1 ml hay 7471750 Células.


Como conclusión podemos decir que en 1 ml de muestra de Scenedesmus hay 7471750 Células.


Debido a la falta de tiempo, la semana que viene realizaremos el recuento de Chlorella kessleri.

Hasta la semana que viene,

Lucas Toiw
Uriel Frid

25 de junio de 2008

Semana VI - 19/06/08

Esta semana nos dedicamos a trabajar con la Dra. Gabriela Chaufan sobre los cometas obtenidos la semana anterior.


Durante el trayecto del día establecimos en la computadora, una escala arbitraria prefijada por nosotros que nos serviria para decidir los valores de los distintos cometas hayados.


Usando un programa especifico que nos permitia usar una regla con escala en cm medimos, en cada nucleo, la distancia entre la zona donde estaria ubicada la membrana nuclear hasta la punta de la respectiva cola del cometa. De esta forma, pudimos establecer los valores de todos los cometas hayados. Se considera que el valor del índice de cometa va desde 0 a 400, tomando como un valor normal hasta 10; de 11 a 400 se considera un daño al ADN.


Lo que centralmente se intenta buscar aqui es en Indice de cometa (relacionado al proceso apoptótico).
La apoptosis es la función que controla la muerte de una unidad biológica, de forma programada.
Para poder obtener el Índice se debe proceder con una sencilla cuenta que consta de la sumatoria de la cantidad hallada de cada Valor de Cometa por su respectivo Valor.


Para poder hallar el Indice de Cometa, produjimos la siguiente escala de valores:
Según el protocolo. el recuento debe hacerse sobre 100 células pero en nuestra práctica obtuvimos menos.


- de 0 a 10 = 0

- de 11 a 20 = 1

- de 21 a 30 = 2

- de 31 a 40 = 3

- > a 40 = 4


Esta tabla compara la longitud del cometa con un valor respectivo arbitrariamente prefijado por nosotros.


De este modo podemos concluir que el Índice de cometa es:

(2x0) + (9x1) + (5x2) + (2x3) + (4x0) =


0 + 9 + 10 + 6 + 0 = 25 ------> Índice de Cometa (relacionado con la apoptosis celular)


También se puede apreciar que los Cometas de Valor 1 son la gran mayoría (con un 50% del total de los cometas medidos), siguiéndoles los Cometas de Valor 0 y 3 (con un 11,11 % en ambos casos). No fueron registrados Cometas de Valor 4.


Cabe destacar que las células fueron cultivadas con una concentración de HCB de 10μg/ml.





Para finalizar el día, fuimos con Gabriela a ver otro proyecto suyo que implementa el uso de cangrejos en un criadero especifico para ellos.

Volveremos a actualizar la semana entrante.

Lucas Toiw y Uriel Frid

Semana V - 12/06/08

Esta semana realizamos la "Técnica del Cometa".
En esta técnica, las células son embebidas en un gel de agarosa de bajo punto de fusión (ABPF) en un portaobjetos, sometidas a lisis y luego corridas por electroforesis durante un corto período en el buffer de corrida.




Primero empezamos preparando los portaobjetos. Para eso les pusimos ABPF, los cubrimos con un cubreobjetos y una vez que el gel se haya solidificado, retiramos el "cubre" cuidadosamente haciendo que el agar quede adherido al portaobjetos.






Luego nosotros trabajamos directamente con portaobjetos ya preparados; pero después de poner esta capa de agarosa en el gel, se deben poner las células tratadas y luego otra capa más de agarosa. Una vez terminado el preparado debe hacerse la lisis en cámara de vidrio





Nosotros, con los portaobjetos ya preparados, procedimos directamente a hacer la Técnica del Cometa.
Colocamos los portaobjetos preparados con hepatocitos humanos tratados con diferentes concentraciones de Hexaclorobenceno sumergidos en buffer en la cuva electroforética y dejamos realizar la corrida a 23V, 400mA.




Una vez terminada la corrida, observamos los cometas y la degradación nuclear en un microscópico fluorescente. Para eso fue necesario teñir las células con Bromuro de Etidio.
El Bromuro de Etidio, lo que hace es "meterse" entre las bases nitrogenadas de los nucleótidos de ADN y emite fluorescencia frente a rayos UV, que son los que utiliza el microscopio fluorescente.








A continuación verán imágenes de los cometas y lo observado en el microscópico.

Hasta la semana que viene!
Uriel Frid
Lucas Toiw

24 de junio de 2008

Semana IV - 05/06/08

En esta semana procedimos a trabajar con la Dra. Angela Juarez. En la misma tuvimos que obtener homogenatos de Chlorella kesseleri y Scenedesmus vacuolatus.
Para poder obtener el mismo se necesitaron:
I) Cultivo de Chlorella kesseleri y Scenedesmus vacuolatus
II) Buffer Fosfato de Potasio 0.134 M de pH 6.5
III) Buffer Fosfato de Potasio 0.134 M de pH 6.5 con Benzamidina 0.2 mM y PMSF (fluoruro de fenilmetil sulfino) 0.5 mM. Estos dos son inhibidores de proteasas.

Antes de comenzar con el procedimiento se deben hacer las siguientes preparaciones de soluciones:

* Buffer Fosfato de Potasio:
Solución stock 1 (bajo pH): PO4H2K 0.1 M (18.23 gr PO4H2K anhidro en 1000 ml de agua destilada)
Solución stock 2 (alto pH): PO4HK2 0.134 M (23.34 gr PO4HK2 anhidro en 1000 ml de agua destilada)
Preparar el Buffer 0.134 M pH 6.5 mezclando 2.5 volúmenes de Sol. 1 con 1 volumen de Sol. 2, agregándola de a poco y verificando el pH en el pHmetro, porque no es la proporción exacta.

* Buffer con inhibidores:
Prepara stock PMSF 0.2 M en etanol y stock benzamidina/ 1 buffer (preparar únicamente la cantidad de buffer con inhibidores necesaria, porque son caros y el buffer final no puede almacenarse)


Luego de haber preparado las correspondientes soluciones, se procedió a la obtención de los homogenatos de Chlorella kessleri y Scenedesmus vacuolatus:

* Cosechar las células por centrifugación (15 min. a 7000 rpm, centrifuga refrigerada)




* Descartar el sobrenadante (medio de cultivo) implementando el uso de la pipeta pasteur



* Lavar las células con 10 ml de buffer Fosfato de Potasio 0.134 M pH 6.5 conteniendo inhibidores de proteasas * Centrifugar 15 min a 7000 rpm (misma centrifuga)


* Descartar el sobrenadante (pipeta pasteur) y recoger las células resuspendiéndolas en el menor volumen posible de buffer con inhibidores ( debe quedar espeso) en un tubo apropiado para sonicar ( eppendorf o tubos centrifuga sorvall)






* Sonicar en sonicador de tip (a la maxima potencia que permita el aparato y el tip) 7 veces por 15 segundos cada vez (con el tip en un vaso de precipitados lleno de hielo y dejando enfriar entre los pulsos). Cabe destacar que el volumen a sonicar no debe sobrepasar la mitad del tubo utilizado, sino este podria romperse ya que el sonicador provoca energia intensa liberada en forma calorica.





Debido a la falta de tiempo, no pudimos seguir. Pero la tecnica termina de la siguiente manera:

* Centrifugar 25 min. a 11500 rpm
* El pellet obtenido corresponde a los núcleos, mitocondrias, cloroplastos y derbis celulares.
* El sobrenadante corresponde a la fracción soluble citosólica y que llamamos sobrenadante de homogenato o extracto algal citosólico (puede almacenarse a -20ºC por unos 15 días para determinar finalmente la actividad UroD)


Lucas Toiw
Uriel Frid

30 de mayo de 2008

Semana III - 29/05/08

Esta semana fue destinada a la búsqueda de información en la biblioteca de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales de Buenos Aires.

Cuando llegamos, fuimos con Isis a la biblioteca. Ella nos explicó como se hacía para buscar textos específicos, cómo hacer una búsqueda de información por tema y en fin, cómo se utiliza la biblioteca de la UBA.

Los temas sobre los que buscamos información fueron:
- Lineas de cultivo celular
- Hexaclorobenceno (HCB)
- Hepatocitos humanos
- Estrés oxidativo
- Antioxidantes

Una vez finalizada la búsqueda, terminó nuestra jornada de trabajo por esta semana.

Seguiremos actualizando como todas las semanas.

Uriel Frid y Lucas Toiw.

Semana II - 22/05/08

Esta semana trabajamos con dos situaciones diferentes:
En la primera parte procedimos a trabajar con Gabriela Chaufan acompañada por Isis, estudiante de segundo año de Biología.

Primero fuimos a un laboratorio equipado para trabajar con cultivos de células. Allí, luego de sacar de la estufa el preparado, observamos el crecimiento de hepatocitos humanos en microscopio invertido.


Luego, una vez que Isis y Gabriela iniciaron cultivos con 300000 células sometidas a diferentes concentraciones de hexaclorobenceno (HCB), realizamos el recuento en cámara de Neubauer.



Previo a eso, realizamos una curva del crecimiento de los hepatocitos en base a recuentos obtuvidos previamente

En una segunda etapa, acompañados por Ángela Juarez, conocimos un laboratorio completamente dedicado al cultivo de microalgas.

Mas tarde preparamos 1,2 litros de BBM suplementado con glucosa.

El BBM es un medio de cultivo para el crecimiento de microalgas verdes compuesto por:

1) NaNO3 ................................................ 10g/400 ml agua bidestilada

2) KH2PO4 ................................................ 7g/400 ml agua bidestilada

3) K2HPO4 ................................................ 3g/400 ml agua bidestilada

4) MgSO4 .7H2O ......................................... 3g/400 ml agua bidestilada

5) CaCl2 .2H2O ......................................... 1g/400 ml agua bidestilada

6) NaCl ............................................... 1g/400 ml agua bidestilada

Las algas que vamos a sembrar dentro de dos semanas son Chlorella kessleri y Scenedesmus acutus

Para la preparación del medio de cultivo contábamos con soluciones stock concentradas de manera tal de utilizar 10ml de solución por cada litro de BBM.

Realizamos cálculos necesarios para preparar 1,2 litros.

El medio de cultivo BBM se suplementó con 1g de glucosa por litro.


Para mezclar la solución utilizamos un mezclador electromagnético:


Para atoclavar la solución, dividimos la misma en 4 erlenmeyers con 300 ml de solución. Éstos fueron tapados con tapones de algodón envueltos en aluminio.


La semana que viene volveremos a actualizar el Blog.

Uriel Frid y Lucas Toiw

21 de mayo de 2008

Semana I - 15/05/08

Al llegar a Ciudad Universitaria nos dirigimos al laboratorio donde pasaremos a trabajar durante la pasantía.
Allí conocimos a la Dra. María del Carmen Ríos de Molina y a todo su equipo de trabajo.

Luego nos dieron una pequeña introducción acerca de lo que se trataba el proyecto.
Este proyecto, basado en la contaminación ambiental, consiste en ver como distintos agentes contaminantes como el Hexaclorobenceno (HCB) y otros, afectan a los seres vivos para poder, con posterioridad, adaptarlo a parámetros humanos. Se toma como patrón para medir la contaminación, el daño que producen estos agentes sobre la Uroporfirinógeno Descarboxilasa (UroD): enzima que actúa en el camino metabólico del grupo Hemo y una de las primeras enzimas en ser afectadas.
Al ser dañada esta enzima, se comprobó que también se daña el material genético con información para sintetizarla, lo que quiere decir que al reproducirse el ser vivo el nuevo ser sufre deformaciones genéticas que van aumentando junto con su descendencia.

Luego, procedimos a presenciar una clase sobre radicales libres dada por Ángela, que forma parte del equipo de trabajo del proyecto.

Más tarde, a las 10:00hs, interrumpimos la clase y nos juntamos con todos los chicos de ORT que estaban realizando pasantías en Ciudad Universitaria, para ver dos videos:
- El primero era sobre seguridad e Higiene dentro de Ciudad Universitaria.
- El segundo era sobre Seguridad e Higiene en los laboratorios de la facultad.

Por último, luego de los videos y de haber presenciado la última parte de la clase de Ángela, tuvimos una pequeña charla con la Dra. María del Carmen Rios de Molina en la que nos explicó todos aquellos contenidos que no nos habían quedado claros de la charla , una parte del metabolismo del Hemo y que la Uroporfirinógeno Descarboxilasa se ocupa de sustituir grupos de ácido acético por metilos en la Uroporfirina III.

A continuación adjuntamos un gráfico que realizamos explicando la función de la UroD (hacer click sobre ella para verla mas grande):


La semana que viene volveremos a actualizar el blog.

Hasta entonces

Uriel Frid
Lucas Toiw

8 de mayo de 2008

PROYECTO QUIMICA ORT DEL GENOMA HUMANO

Investigacion en Bioquimica Molecular y Proteómica 2008

Por cuarto año consecutivo los alumnos del ultimo año de la especialidad Quimica de la escuela ORT Argentina realizaran sus proyectos finales en distintas universidades y centros de investigacion con profesionales reconocidos. La metodologia de trabajo evita la transposicion didactica permitiendo a los estudiantes realizar su actividad final en los lugares donde se esta generando el conocimiento.
La articulacion entre nivel medio y el posgrado es auspiciada por el CONICET (Consejo Nacional De Investigacion Cientifica...).
Los proyectos de investigacion para el año en curso son:

1) Evaluacion de la expresion de la molecula de adhesion Cadherina epitelial en tejidos humanos normales y tumolares.
Investigador:Doctora monica Vazquez-Levin.
Instituto de Biologia y Medicina Molecular ( IBYME-CONICET).
Alumnos: Yael Dobzewicz y Gala Szapiro.
Link: http://proyecto-6q.blogspot.com

2) Accion del Hexaclorobenceno (HCB) sobre la Uroporfirinogeno Decarboxilasa de una linea celular de Hepatocitos humanos. Mecanismo de accion.
Investigador:Doctora Maria del Carmen Rios de Molina.
Instituto: Departamento Quimica Biologica, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales.
Alumnos: Lucas Toiw y Uriel Frid.
Link: http://proyectofird-toiw08.blogspot.com

3)Modelos experimentales de enfermedades metabólicas: Porfiria y Síndrome Metabólico. Proteómica y Metabolómica de estos disturbios.
Investigador: Dra. Marta Blanca Mazzetti.
Instituto: Departamento de Química Biológica, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales (UBA). Alumnos: Maria Duperron y Mauro Elencwajg.
Link: http://proyectofinal6q.blogspot.com/

4) Factores no hemodinámicos relacionados con la génesis y evolución de la proteinuria durante la enfermedad renal progresiva.
Investigador: Dra. Elsa Zotta.
Instituto: Laboratorio de Fisiopatogénia, Departamento de fisiología, Facultad de medicina, UBA. Alumnos: Barbara Helueni y Melanie Naiman.
Link: http://proyectoq08.blogspot.com/

5) Estudio de la participacion de la anandamida en la regulacion de la interaccion espermatozoide-ovioducto en un modelo bovino.
Investigador: Dra. Silvina Perez Martinez.
Instituto: Facultad de medicina - UBA
Alumnos: Judith Arenas Tenenbaum y Melina Braverman
Link: http://scienceproject08.blogspot.com/

6) El estudio de los mecanismos moleculares involucrados en la regulación del gen UGA4 de Saccharomyces cervisiae en respuesta a cambios en la disponibilidad de nutrientes con el fin de dilucidar las distintas cascadas de señales desencadenadas por dichos nutrientes y establecer sus interconexiones.
Investigador: Dra Susana Correa García.
Instituto: Departamento de Química Biologica, Facultad de ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires.
Alumnos: Iván Mikiej y Victoria Salama
Link: http://proyectoquimica22.blogspot.com/

7) Diagnóstico de la enfermedad de Von Willebrand (VWD) tipo 2N por técnicas fenotípicas y genotípicas.
Investigador: Dra. Adriana I. Woods.
Instituto: Instituto de Investigaciones Hematológicas "Mariano R. Castex" de la Academia Nacional de Medicina.
Alumnos: Abigail Skverer y Daniela Lin
Link: http://vwd-diagnostico.blogspot.com/

8) Estudio de la mielinogenesis en el sistema nervioso periferico en condiciones fisiologicas y patologicas. Participacion de celulas pluripotentes en el proceso de degeneracion-regeneracion nerviosa.
Investigador: Dra Patricia Setton-Avruj.
Instituto: Dpto de Quimica Biologica, Facultad de Farmacia y Bioquimica (IQUIFIB-UBA-CONICET).
Alumnos: Averbuj Daniel y Eitan Rozenszajn.
Link: http://proyectoaverbuj-rozenszajn.blogspot.com/

9) Diseño y desarrollo de vacunas antitumorales empleando bacterias y celulas tumorales modificadas con genes inmunomodiladores. Estudio de los mecanismos inmunes inducidos.
Investigador: Claudia I. Waldner y Claudia Mongini.
Instituto: Laboratorio de inmunologia celular y molecular. Centro de Estudios Farmacologicos y Botanicos (CEFYBO. CONICET-UBA)
Alumnos: Amalia Surijon y Maria Belen Tolava Rivero
Link: http://amibeluproyecto.blogspot.com/

10) Marcadores Geneticos Asociados al Cáncer
Investigador: Dr.Javier Hernán Cotignola
Instituto: Laboratorio de Cáncer y Apoptosis del Departamento de Quimica Biologica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales de la Universidad de Buenos Aires.
Alumnos: Ayelén Marano y Solange Perchik
Link: http://marcadoresgeneticos.blogspot.com/

11) Expresion del canal de la conductancia transmembranal de la Fibrosis Quistica (CFTR) en placentas Preeclampticas: posible rol en la regulacion de la actividad de la Acuoporina-9 (AQP9).
Investigador: Dr Alicia E Damiano
Instituto: Catedra de Biologia Celular, Departamento de Ciencias Biologicas, Facultad de Farmacia y Bioquimica (UBA)
Alumnos: Gabriel Colodenco y Martín Sapir.
Link: http://proyectofinalcs.blogspot.com/

12) Proteómica de factores secretados por células de cáncer de mama y mama normal con capacidad inhibitoria de la producción lipídica.
Investigador: Dra.Guerra de Grignoli Liliana Noemi
Instituto: Departamento de Ciencias biologicas. Facultad de ciencias exactas y naturales,UBA-CONICET.
Alumnos: Fabiana Durante y Tamara Broitman.
Link: http://tyf-proyecto08.blogspot.com/

13) Neovascularizaciòn en un modelo murino de inflamaciòn aguda inducida por LPS.
Investigador:Eulalia de la Torre.
Instituto: Facultad de Medicina - Uba - Laboratorio de Inmunofarmacologia
Alumnos: Federico Mauas Walach, Pablo Kuleff.
Link: http://finalproyectort.blogspot.com/

14) Estudio de la Growth Associated Protein (GAP-43), su interacción con la Ubicutina y su participación en el control del ciclo celular en células NIH3T3 transfectadas en forma estable y transiente. Efecto de la Apo-transferrina en la remielización: participación de la vía Notch en la diferenciación oligodendrioglial.
Investigador: Doctora Ana M. Adamo.
Instituto: Departamento de Química Biológica Patológica, Facultad de Farmacia y Bioquímica de la UBA. CONICET.
Alumnos: Rodrigo C. Pampin y Robby Mattes
Link: http://gap-43.blogspot.com